Naisa es un modelo de referencia en el mundo gracias a sus buenas prácticas de la utilización de recursos. Wilfredis Forero, encargado de sanidad vegetal, comenta que el tratamiento químico es una actividad que no se utiliza ni tampoco se pone en práctica en la empresa.
Esto se debe a que el objetivo principal de Naisa es conservar todos esos servicios ecológicos que naturalmente trabajan para permanecer por debajo de los umbrales de daño económico los niveles de la plaga. De igual forma, mantener un control sobre el manejo sanitario de todas las enfermedades que se registran al nivel del cultivo.
Naisa utiliza buenas prácticas agrícolas para proteger el suelo, las cuencas y los arroyos.